หนูแฮมสเตอร์เป็นสัตว์ขนาดเล็กจึงไม่ต้องการอาหารมากนักและไม่จำเป็นต้องมีราคาแพง แต่สิ่งสำคัญคือมันไม่สามารถกินอาหารได้เหมือนเราทุกชนิด อาหารของหนูแฮมสเตอร์แบ่งออกได้เป็นหลายประเภทดังนี้ 1. อาหารแห้ง อาหารแห้งเป็นแหล่งสารอาหารพื้นฐานของหนูแฮมสเตอร์ ได้แก่ เมล็ดทานตะวัน ข้าวสาลี ข้าวโอ๊ต ข้าวโพด ถั่วลิสง เมล็ดฟักทอง เฮเซลนัท วอลนัท และหญ้าอบแห้ง เป็นต้น โดยอาหารสำเร็จรูปที่ขายอยู่ตามร้าน pet shop มักจะมีอาหารเหล่านี้ผสมกันอยู่แล้ว อาหารที่ดีจะมีสัดส่วนของสารอาหารที่เหมาะสมดังนี้คือ คาร์โบไฮเดรต 60-65 % โปรตีน 16-24 % ไขมัน 3-10 % เส้นใย (fiber) 8% น้ำ (ส่วนที่เป็นความชื้น) ในการเลือกซื้อควรดูวันที่ผลิตและวันหมดอายุด้วย ถ้าเป็นไปได้ควรเลือกซื้ออาหารแห้งใหม่ๆ ไม่เป็นผง ไม่มีกลิ่นอับหรือเหม็นหืน

2. อาหารชื้น ได้แก่หญ้าสดสีเขียว ผลไม้และผักซึ่งมีวิตามินและแร่ธาตุเพียงพอกับความต้องการของหนูแฮมสเตอร์ - หญ้าที่ให้หนูกินอาจเก็บจากสนามหน้าบ้านของคุณก็ได้แต่อย่านำหญ้าจากข้างถนนหรือแหล่งที่มีการทำเกษตรให้มันเพราะ หนูอาจได้รับอันตรายจากการกินถูกแร่ที่ใช้ทำถนน ปุ๋ย และสารปราบศัตรูพืช - ผลไม้ สามารถให้ได้ตามฤดูกาลเช่น กล้วย สตรอว์เบอร์รี่ ราสเบอร์รี่ องุ่น แอปเปิล ลูกแพร ไม่ควรให้ผลไม้จำพวกส้มเพราะมีกรดซิตริกอยู่มากเกินกว่าที่หนูจะรับได้ ถ้าให้ดีควรซื้อผลไม้จากร้านที่ขายอาหารปลอดสารพิษเพื่อให้แน่ใจว่าหนูของท่านจะไม่ต้องตายเพราะสารพิษจากผลไม้ - ผัก ได้แก่ แครอท ถั่วเขียว ผักขม แตงกวา บรอคโคลี่ มะเขือเทศ และมันฝรั่งเป็นต้น

3. น้ำดื่ม น้ำเป็นสิ่งจำเป็นอย่างยิ่งที่ขาดไม่ได้ โดยเฉพาะหนูแฮมสเตอร์ที่ไม่ได้กินอาหารสดที่มีความชื้น การขาดน้ำจะมีผลกระทบต่อสุขภาพหนูอย่างมาก และเป็นสาเหตุให้หนูแฮมสเตอร์ของหลายท่านต้องเสียชีวิตก่อนวัยอันควร น้ำดื่มที่ให้ควรเป็นน้ำสะอาดแบบที่คนดื่มได้ ถ้าจำเป็นต้องให้น้ำประปาต้องนำไปต้มก่อนเพราะมีคลอรีนอยู่ ห้ามให้น้ำอัดลมแก่หนูเพราะคาร์บอนไดออกไซด์ในน้ำจะทำให้หนูเสียชีวิตได้ การให้น้ำเราสามารถหาซื้อขวดน้ำสำหรับหนูได้ตามร้าน pet shop ทั่วไป และควรเปลี่ยนน้ำทุกวัน